六安市城南中学创办于1969年8月，原名城南镇中心小学（附设初中部）。1970年迁址到城南镇宝丰寺，更名为城南初中。1972年再度迁址到现在校址，同年增设高中部。2001年被市政府确定为市级示范高中，2006年7月被批准为安徽省示范性普遍高中。