生物沉积（biogenic deposit）是指由生物活动结果形成的沉积物。它包括由生物遗体或遗物（如粪便）直接形成的沉积物，如硅藻土、贝壳层、鸟粪层、泥炭、煤等；也包括与生物生命活动有密切关系的各种沉积物，如磷块岩，某些石灰岩、石油等。生物沉积物多形成于海洋中，部分形成于湖沼中。